Application R-Shiny HowTo

Ce projet template utilise un format basic d'une application R-Shiny.

Dans ce template on dispose de :

• ui.R la partie interface
• server.R la partie serveur
• global.R les définitions globals
• www/ Répertoire pour les fichiers statics
• .gitlab-ci.yml gère l'intégration continue pour l'application
• .gitlab-ci-sk8.yml intégration continue de SK8 pour l'application
• .dockerignore fichiers ou repertoires a ne pas inclure dans l'image docker

Développement de l'application.

Compléter/modifier/changer les fichiers ui.R, server.R et global.R .

Merci d'ajouter les remerciements et hébergement par SK8

c.f.: footer.html

div(
    class="footer",
    includeHTML("footer.html")
)

Vous pouvez le modifer et/ou inclure les informations qu'il contient d'une manière qui soit plus en résonance avec votre application (merci de garder le logo à minima).

Pour récupérer l'image docker de mon application

## Connection au dépôt image docker si le projet est privée.
docker login -u <uid> -t <token_gitlab> registry.forgemia.inra.fr
## Téléchargement et instantiation du container (l'application) sur sa machine.
docker run -it -p 3838:3838 registry.forgemia.inra.fr/<Chemin du projet>:latest

Accès à l'application:
http://localhost:3838

Fonctionnement du pipeline d'intégration

L'accès au pipeline s'effectue via le menu de gauche (CI/CD).
Le dernier pipeline activé (au dernier commit and push) est le premier de la liste.
En cliquant sur le pipeline, on a accès à différentes actions.
La configuration et la construction automatique de l'image (docker) de mon application. Ainsi que des actions manuelles pour : publier et dépublier mon application, annuler la dernière publication, recevoir les logs de mon application.

Documentations

Pour avoir plus d'information sur les modifications possibles https://forgemia.inra.fr/sk8/sk8-conf/sk8-template-ci/ et la documentation en ligne.

Problèmes / questions

Contact via une issue : https://forgemia.inra.fr/sk8/sk8-support de préférence.
Ou par email contact-sk8@groupes.renater.fr